二十世纪四十年代，日本在第二次世界大战中失败。日本国内商品极度匮乏，人们无法买到化肥等农资，只能依赖自制肥料。当时，日本爱知县的Kinji Shibata先生，发明了一种利用微生物发酵树叶生产肥料的方法，并逐渐被一部分农民施用，但由于技术原因，成功的事例较少。
       该技术传到一家名叫Oomoto的农场，经岛本觉也（Kameoka Kyoto）的改进，同时结合微生物学和酶学等方面的技术，发展成为比较完美的技术体系，称之为岛本农业微生物技术，又称为酵素菌技术。
     1948年2月，岛本先生倡导成立了科技组织，专门从事该技术的科研推广工作。他们于1949年10月正式出版了《酵素菌技术在农业上的应用》一书，成为当时的畅销书。人们纷纷效仿概述提供的技术，生产肥料，培肥土壤，取得了良好的效果。
        经过无数次的实验，他们于1953年，生产出了第一批酵素菌种。该产品是将能够产生酶的微生物扩大培养后，进行固化，能够长期保存。该产品的问世大大加快了农民的使用酵素菌技术的步伐。
     酵素菌技术的目的在于有效利用微生物资源改良土壤，为农业持续发展，农作物高产优质创造条件。